برپايه گزارش ارسالي از سوي سازمان سنجش آموزش كشور در سال تحصيلي 89-88، 742 نفر از دانش آموختگان دانشگاه سيستان و بلوچستان در مقطع كارشناسي ارشد پذيرفته شدند كه اين آمار در مقايسه با سال گذشته 22% افزايش داشته است.
لازم به ذكر است آمار اعلام شده در خصوص پذيرش دانشجويان اين دانشگاه در مؤوسسات آموزش عالي دولتي مي باشد كه پيش بيني مي گردد قريب به همين تعداد نيز در دانشگاه هاي آزاد پذيرفته شده باشند.