در اين بخش كليه پرونده هاي مربوط به مراجع قضايي پيگيري مي شود . پرونده هاي مربوط به دانشجويان مستنكف كه در دادگاهها مطرح است ، پرونده هاي ديگري كه حسب مورد تشكيل شده و يك طرف آن وزارت متبوع است مثل دعاوي ملكي ، كيفري و دعاوي مطروحه در ديوان عدالت اداري در اين بخش تحت پيگيري مي باشد . با توجه به اهميت دفاع از دعاوي مطروحه عليه وزارت متبوع و پيگيري دعاوي اقامه شده عليه اشخاص در اين بخش ، سه نفر از كارشناسان حقوقي ورزيده و داراي تحصيلات عاليه دفترحقوقي (دانشجوي دكتري و فوق ليسانس ) مشغول به كارند و زير نظر كارشناس ارشد حقوقي اداره مي شوند. اهم پرونده هاي مطروحه در اين اداره به شرح ذيل است:
1- دعاوي عليه بورسيه ها و ارزبگيران مستنكف وپاسخگويي ودفاع در مقابل دعاوي مطروحه عليه وزارت متبوع و دانشگاهها و موسسات تابعه از سوي آنان .
2- دفاع از مقامات وزارت متبوع ، روساي دانشگاهها و ساير مسئولين ذيربط در محاكم دادگستري ، ديوان عدالت و ... به مناسبت شغل و وظيفه قانوني آنان.
3- دفاع از دعاوي مطروحه توسط دانشجويان يا اشخاصي كه به نحوي رابطه استخدامي با وزارت متبوع يا دانشگاهها داشته و تقاضاهاي غيرقانوني دارند.
4- راهنمايي ، مشاوره و دفاع از كاركنان وزارت متبوع به مناسبت شغل و وظيفه آنان .
لازم به توضيح مي باشد كه برخي از اين پرونده ها از جنبه مالي بسيار حائز اهميت بوده و در صورت سهل انگاري ممكن است خسارات فراوان مالي به دولت وارد آيد و برخي از پرونده ها نيز به لحاظ اجتماعي و سياسي داراي اهميت است كه گاه جنبه بين المللي نيز پيدا مي كند.